上海市人民政府设置工作部门。监察局和纪律检查委员会机关合署办公，列入市政府机构序列，不计入政府机构个数；发展和改革委员会挂物价局牌子，经济和信息化委员会挂国防科技工业办公室牌子，地方税务局和国家税务局合署办公，人力资源和社会保障局挂外国专家局、医疗保险办公室牌子，卫生和计划生育委员会挂中医药发展办公室牌子，新闻出版局挂版权局牌子，民防办公室挂人民防空办公室牌子，市政府合作交流办公室挂市政府协作办公室、市政府接待办公室牌子，绿化和市容管理局挂林业局、城市管理行政执法局牌子，海洋局和水务局合署办公。                                                               

此外，设置部门管理机构：市政府参事室由市政府办公厅管理，粮食局由商务委员会管理，监狱管理局由司法局管理，社会团体管理局由民政局管理，公务员局由人力资源和社会保障局管理。